Quels sont les effets d'un pH alcalin sur la structure de l'ADN

? Normalement chaque molécule d'ADN de vos cellules contient deux brins reliés entre eux par des interactions dites liaisons hydrogène . Modification des conditions peut cependant " dénaturer " l' ADN et de l'origine de ces brins à se séparer . Ajoutant des bases fortes , comme le NaOH , le pH augmente considérablement , diminuant ainsi la concentration en ions hydrogène de la solution et la dénaturation de l'ADN double brin. Effets du pH

La concentration en ions hydroxyde et de pH ont une corrélation directe , c'est à dire plus le pH est élevé, plus la concentration de l'hydroxyde . De même, plus la concentration en ions hydrogène tombe . À pH élevé , alors , la solution est riche en ions hydroxyde , et ces ions chargés négativement peut tirer des ions d'hydrogène hors de molécules comme les paires de bases de l'ADN . Ce processus perturbe la liaison hydrogène qui détient les deux brins d'ADN ensemble, les obligeant à se séparer .
ARN vs ADN

Contrairement à l'ARN , l'ADN n'a pas un groupe hydroxyle sur la position 2 ' dans chacun des groupes de sucre. Cette différence permet d'ADN beaucoup plus stable dans une solution alcaline . Dans l'ARN , le groupe hydroxyle sur la position 2 ' peut céder un ion hydrogène de la solution à un pH élevé , ce qui crée un ion alcoolate hautement réactif qui attaque le groupe phosphate contenant deux nucléotides voisins ensemble. ADN ne souffre pas de ce défaut et donc bénéficie d' une remarquable stabilité à pH élevé.

Lyse alcaline

biologistes moléculaires font souvent usage de dénaturation alcaline pour isoler le plasmide ADN provenant de bactéries. Les plasmides sont des petites boucles d'ADN séparer du chromosome bactérien . Dans une mini-préparation de lyse alcaline , biologistes ajouter un détergent et de l'hydroxyde de sodium à des bactéries en suspension dans la solution. Le détergent dissout la membrane de la cellule bactérienne tandis que l' hydroxyde de sodium augmente le pH et rend la solution fortement alcaline . Comme les cellules brisées libèrent leur contenu , l' ADN à l'intérieur se sépare en ses brins constitutifs , ou dénature .
Renaturation

Une fois le biologiste extrait l'ADN de la cellule , il ajoute un autre réactif pour renvoyer la solution à un pH plus neutre et précipiter le détergent . La variation de pH permet aux brins du plasmide à se réanneler; le chromosome volumineux , cependant, ne peut pas faire la même chose , de sorte que le biologiste peut retirer avec le détergent , les protéines dénaturées et autres cochonneries assortis, laissant le plasmide derrière . Lyse alcaline ne purifie pas complètement l'ADN plasmidique; plutôt , il sert de « rapide et sale " façon à l'extraire de la cellule et de supprimer la plupart des autres contaminants .