La Game Boy Advance possède un emplacement pour cartouche différent et utilise un processeur différent de celui de la Game Boy originale. Bien qu'il existe quelques exceptions (comme la Game Boy Color, qui est compatible avec la Game Boy Advance), les jeux Game Boy ne sont pas compatibles avec la Game Boy Advance.
Vous pouvez cependant jouer aux jeux Game Boy et Game Boy Color sur une Game Boy Advance SP. en utilisant un Game Boy Player accessoire pour le Nintendo GameCube.